Le personnel professionnel de l’INSPQ comprend notamment des conseillers scientifiques dans le domaine de la santé environnementale, de la toxicologie, des maladies infectieuses, du développement des individus et des communautés et de la santé au travail, mais aussi des spécialistes cliniques en biologie médicale, chimistes, agents d’information, bibliothécaires, statisticiens, épidémiologistes, géomaticiens, et analystes informatiques.
Le Syndicat des professionnelles et professionnels de la santé publique du Québec et le Syndicat des professionnelles et professionnels du Laboratoire de santé publique du Québec sont affiliés à la Centrale des syndicats du Québec.